A humidoron belül tapasztalható egyenlőtlen páratartalom igen gyakori probléma a humidorok esetében. Különösen abban az esetben fordul elő, ha a humidor maximális kapacitása szinte teljesen ki van használva, illetve a nagyméretű, rekeszes humidorok esetében a párásító rendszer közelében magasabb a páratartalom, mint attól távolabb. Éppen ezért, a hosszú ideig tárolt szivarok helyét 1-3 havonta változtatni kell a humidoron belül.
A mai modern humidor modellek legtöbbjét azonban már különös gondossággal tervezték olyanra, hogy a levegő a lehető legjobban cirkulálhasson a szivardobozok belsejében, ezáltal biztosítva a tároláshoz szükséges legkedvezőbb feltételeket. Az olyan innovatív funkciók, mint például a humidor alján és az oldalfalain található levegő keringtető bordázott belső kialakítás, valamint a különleges tálca, amelynek szellőző rései vannak, biztosítják a levegő szabad cirkulálását anélkül, hogy a szivarok helyét időről-időre változtatni kellene a humidoron belül.